MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 3355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	T	6	6	1440	1445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006360	TTA	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006360	TAT	2	6	1479	1484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006360	TAAA	2	8	1491	1498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006360	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006360	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006360	T	6	6	2696	2701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006360	A	7	7	2713	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006360	A	8	8	2743	2750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006360	A	6	6	7059	7064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006360	T	6	6	7089	7094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006360	T	8	8	7097	7104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006360	A	8	8	7116	7123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006360	TGG	2	6	7131	7136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006360	ATT	2	6	7735	7740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006360	A	6	6	7758	7763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006360	TAATTT	2	12	7765	7776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006360	TAA	2	6	7783	7788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006360	T	6	6	8828	8833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006360	T	6	6	8869	8874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006360	T	6	6	8879	8884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006360	AATAA	2	10	8886	8895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006360	A	8	8	8894	8901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006360	A	8	8	8906	8913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006360	TAAA	2	8	8924	8931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006360	ATTT	2	8	8949	8956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006360	T	6	6	11013	11018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006360	A	7	7	11019	11025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006360	T	6	6	11068	11073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006360	T	20	20	14686	14705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006360	A	18	18	14721	14738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006360	TAT	2	6	16489	16494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006360	TTA	2	6	16497	16502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006360	T	8	8	17621	17628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006360	TAA	2	6	17630	17635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006360	TAA	2	6	17644	17649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006360	A	17	17	17665	17681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006360	TATAA	2	10	17683	17692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006360	A	7	7	17701	17707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006360	T	9	9	19356	19364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006360	TA	4	8	19377	19384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006360	T	6	6	19391	19396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006360	T	6	6	19442	19447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006360	TA	3	6	19466	19471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006360	ATT	2	6	19476	19481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006360	AAT	2	6	19510	19515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006360	AAT	2	6	19595	19600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006360	AAAAT	2	10	19611	19620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006360	T	6	6	19654	19659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006360	ATTA	2	8	19902	19909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006360	ACCA	2	8	19922	19929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006360	AAT	2	6	19961	19966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006360	AAT	2	6	19988	19993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006360	T	7	7	20004	20010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006360	ATT	2	6	20017	20022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006360	A	6	6	22332	22337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006360	ATT	2	6	22352	22357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006360	GTT	2	6	22372	22377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006360	T	7	7	22382	22388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006360	AAT	2	6	22401	22406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006360	AATTA	2	10	22410	22419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006360	T	7	7	22436	22442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006360	T	6	6	22445	22450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006360	A	7	7	22471	22477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006360	TA	3	6	22491	22496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006360	AATTA	2	10	24769	24778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006360	T	6	6	24785	24790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006360	T	6	6	24814	24819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006360	TTG	2	6	28008	28013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006360	TAT	2	6	28031	28036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006360	AAT	2	6	28039	28044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006360	A	20	20	28051	28070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006360	TAAA	2	8	28075	28082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006360	TAG	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006360	A	6	6	28090	28095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006360	T	6	6	28109	28114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006360	TCC	2	6	30439	30444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_006360	T	7	7	30455	30461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006360	TAT	2	6	30479	30484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006360	TAT	2	6	30487	30492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006360	T	6	6	30511	30516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006360	TTTG	2	8	33667	33674	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006360	TTA	2	6	33694	33699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006360	ATT	2	6	33705	33710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006360	ATT	2	6	33713	33718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006360	A	22	22	33775	33796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006360	AAGAAA	2	12	33799	33810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006360	A	6	6	33808	33813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006360	AGA	2	6	33821	33826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006360	ATT	2	6	33855	33860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006360	T	6	6	33886	33891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006360	ATT	2	6	33902	33907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006360	TTA	2	6	33908	33913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006360	ATTA	2	8	33925	33932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006360	TAT	2	6	33961	33966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006360	T	7	7	33987	33993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006360	AAAT	2	8	34011	34018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006360	TAA	2	6	34020	34025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006360	T	6	6	34539	34544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006360	TTAT	2	8	34576	34583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006360	A	6	6	34586	34591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006360	TAA	2	6	34592	34597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006360	A	6	6	34627	34632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006360	TC	3	6	34650	34655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006360	A	6	6	34768	34773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006360	AAC	2	6	34840	34845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006360	TTG	2	6	37645	37650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006360	A	7	7	37683	37689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006360	ATTT	2	8	37693	37700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006360	T	7	7	37698	37704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006360	T	6	6	37780	37785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006360	TAG	2	6	37791	37796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006360	T	6	6	37813	37818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006360	A	6	6	37819	37824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006360	T	6	6	38377	38382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006360	AAT	2	6	38406	38411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006360	A	6	6	38416	38421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006360	A	6	6	38430	38435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006360	TAA	2	6	38445	38450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006360	TAA	2	6	38453	38458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006360	TAAAT	2	10	46202	46211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006360	AAT	2	6	46228	46233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006360	A	7	7	46260	46266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006360	AAT	2	6	46284	46289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006360	T	6	6	46303	46308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006360	T	7	7	46310	46316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006360	AGTA	2	8	47386	47393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006360	ACT	2	6	47412	47417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006360	TAA	2	6	47438	47443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006360	T	6	6	49496	49501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006360	T	6	6	49526	49531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006360	TAA	2	6	49554	49559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006360	T	7	7	49560	49566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006360	A	9	9	49567	49575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006360	AAT	3	9	51930	51938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006360	TAA	2	6	51941	51946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006360	TAA	3	9	53498	53506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006360	T	7	7	54536	54542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006360	TTG	2	6	54560	54565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006360	T	6	6	54583	54588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006360	TAA	2	6	54597	54602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006360	A	6	6	54601	54606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006360	T	7	7	54640	54646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006360	A	6	6	54648	54653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006360	T	6	6	54661	54666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006360	ATT	2	6	56750	56755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006360	ATT	2	6	56789	56794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006360	A	8	8	56796	56803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006360	TA	3	6	58497	58502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006360	ATT	2	6	58873	58878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006360	A	6	6	61223	61228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006360	AAAATT	2	12	61552	61563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006360	A	7	7	61583	61589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_006360	A	7	7	123288	123294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_006360	AAG	2	6	169736	169741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_006360	CAA	2	6	169785	169790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_006360	T	6	6	171624	171629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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